小组赛过后，排名各组第一的球队分别是：波尔多、曼联、皇家马德里、切尔西、佛罗伦萨、巴塞罗那、塞维利亚、阿森纳。小组第二球队有拜仁慕尼黑、莫斯科中央陆军、AC米兰、波尔图、里昂、国际米兰、斯图加特、奥林匹亚科斯。
此次抽签的原则和以往相同，即：小组赛第一名的球队对另一任意小组的第二，而同组和同足协的球队启动回避原则。此外，小组第二的球队将在两回合的1/8决赛中先主后客。
欧冠1/8决赛将于北京时间2010年2月17/18日和24/25日进行首回合争夺，3月10/11日和17/18日进行次回合比赛，获胜的球队成为最终的8强。1/4决赛和半决赛的抽签仪式同样是在瑞士尼翁举行，时间是2010年3月20日。最终的决赛将于2010年5月23日在皇家马德里的主场伯纳乌球场举行。